Provoz vnitřních vodovodů se řídí zejména podle ČSN EN 806-5 Vnitřní vodovod pro rozvod vody určené k lidské spotřebě - Část 5: Provoz a údržba, která stanovuje povinnosti provozovatele k zajištění spolehlivého provozu, zejména k zamezení stagnace vody v těch částech vodovodu, které se používají zřídka. Celý objem potrubí se musí vyměnit min. 1×/týden. 7 dní je i hranice, kdy vodovod musí být uzavřen uzávěrem a vypuštěn, není-li používán. V této normě jsou i související normy pro filtry, zařízení na úpravu vody, armatury. Doplňuje ji česká zbytková norma ČSN 75 5409 (původní číslo ČSN 73 6660) Vnitřní vodovody a ČSN EN 1717 (75 5462) o ochraně proti znečištění zpětným průtokem.
U rozvodu studené vody se předpokládá návrhová teplota min. 20 °C a u rozvodů teplé vody min. 60 °C. Teplota teplé vody je uvedena v ČSN 06 0320 (dosažena po 30 s od úplného otevření výtokové armatury). Pokud to není možné dodržet, musí se navrhnout cirkulace nebo přihřívání potrubí teplé vody samoregulačním elektrickým topným kabelem. Přerušování provozu cirkulačního čerpadla se nedoporučuje. (Přerušovaný provoz cirkulačního čerpadla s max. přestávkou 8 h/24 h.) Prvky vnitřního vodovodu musí odpovídat nejvyššímu provoznímu přetlaku alespoň 1000 kPa. Životnost armatur je stanovena v normách výrobků.
Požadavky na kontrolu a údržbu. Doporučuje se alespoň 1×/rok zkontrolovat funkčnost a stav vodoměrů, 1×/6 měsíců zvyšovací tlakové, přerušovací nádrže musí být min. 1×/rok vypuštěny a vyčištěny a 2×/rok je nutné odebrat vzorek podle přílohy 5 vyhlášky č. 252/2004 Sb., armatury proti zpětnému proudění 1×/6 měs. nebo 1×/rok. Norma ČSN EN 806-5 obsahuje 3 přílohy s četnostmi kontrol a údržby součástí vnitřních vodovodů.
Majitel vnitřního vodovodu musí mít informace o uvedení do provozu a údržbě. Záznamy o údržbě musí být vedeny tak, aby potřebné údaje byly dohledatelné. Z toho nepřímo vyplývá požadavek na vyhotovení provozního řádu a vedení provozního deníku (může být i v elektronické podobě).
Základní zbytková norma pro vnitřní kanalizaci je ČSN 75 6760: 2003 Vnitřní kanalizace a řeší i provoz gravitačních systémů vnitřní kanalizace. Platí zároveň s normou ČSN EN 12056-5 Vnitřní kanalizace - Gravitační systémy - Část 5: Instalace a zkoušení, pokyny pro provoz, údržbu a používání. Je povinná údržba kanalizačních armatur, např. přivětrávací hlavice 2×/rok kontrola funkce, čištění odlučovače ropných látek 4 × do roka dle ČSN EN 858-2, pravidelné čištění Lapače střešních splavenin.
Nová směrnice o čištění městských odpadních vod nastaví nové povinnosti. Např. čtvrtý stupeň povinného čištění pro velká města. Má vodu zbavit látek, které se dostávají do odpadní vody z farmaceutického nebo kosmetického průmyslu.